Influence des corridors écologiques pour les microorganismes symbiotiques des plantes: application en agroécologie (CORRIBIOM)
Contexte et Objectifs
Le rôle des microorganismes sur le fonctionnement des écosystèmes est démontré par de nombreux travaux – des travaux qui suggèrent aussi une place importante de ce compartiment dans le développement de l’agriculture de demain. En particulier les intéractions microorganismes-plantes, notamment différents champignons symbiotiques, sont profondément impliqués dans la productivité des agrosystèmes, les microorganismes fournissant de nombreuses fonctions écologiques à leurs hôtes.
CORRIBIOM a pour objectif d’analyser la transposition de concepts d’écologie du paysage – en particulier le concept de corridor écologique – pour mieux comprendre les règles d’assemblage des microorganismes. Ce projet se focalise notamment sur les écosystèmes agricoles où le maintien de la fertilité des sols, dépendant notamment de la qualité du réservoir de microorganismes présents et recrutables par les plantes cultivées, est un enjeu de recherche très important.
Dans ce contexte, CORRIBIOM est structuré en 4 taches principales que sont
1) l’analyse de macro-corridors,
2) l’analyse de micro-corridors,
3) une réflexion conceptuelle sur le concept de corridor écologique pour les microorganismes ,
4) le développement de nouvelles pratiques agricoles permettant d’implémenter des corridors écologiques pour les microorganismes.
L’utilisation de corridors écologiques pour la préservation de la fertilité des sols peut être mobilisée dans le développement de nouvelles pratiques d’agroécologie.
Publications
Publications
Mony, C., Uroy, L., Khalfallah, F., Haddad, N. & Vandenkoornhuyse, P., 2022. Corridors for the invisibles. Ecography. e06041. doi: 10.1111/ecog.06041
Hu, J., Vandenkoornhuyse, P., Khalfallh, F., Causse-Veidrines, R., Mony, C., 2023. Ecological corridors homogenize plant root endophytic mycobiota. New Phytologist. 237: 1347-1362. doi.org/10.1111/nph.18606
Hu, J., Ricono, C., Fournier, P., Mondy, S., Vandenkoornhuyse, P., Mony, C., 2023. Weeds as auxiliaries for crop plants: the role of their mycobiota for sustainable agriculture. Journal of Ecology, in press. doi.org/10.1111/1365-2745.14073
Présentations (symposia and international conferences)
Hu, J., Ricono, C., Vandenkoornhuyse, P., Alignier, A., Mony, C., 2022. “Weeds as auxiliary plants for crops: the role of their mycobiota for sustainable agriculture” (Oral Presentation), Netherlands Annual Ecology Meeting 2022, Sep.20-21,2022 Wageningen, the Netherlands.
Hu, J., Ricono, C., Mondy, S., Vandenkoornhuyse, P., Mony, C., 2022. “The neighbourhood effect of weeds on crop root endospheric mycobiota” (Oral Presentation), Symbiosis in the Anthropocene Era: 10th Congress of the International Society of Symbiosis / 3rd International Conference on Holobionts, July 25-29, 2022 Lyon, France.
Hu, J., Mony, C., Vandenkoornhuyse, P., Richter, L., Jousset, A., Kowalchuk, G.A., 2022. “Impact of roots on fine-scale biogeography of soil bacterial communities: metacommunity dynamics in rhizosphere” (Poster), ISME18: 18th International Symposium on Microbial Ecology, August 14-19, 2022 Lausanne, Switzerland.
Mony, C., 2021. Le paysage des invisibles : l’application de l’écologie du paysage aux microorganismes. Rencontres d’Ecologie du Paysage, 11-12 Octobre, 2022 Rennes, France.
Mony, C., Hu, J., Gaudu, V., Causse-Vedrines, R., Vandenkoornhuyse, P. 2022. Plants affect root-associated fungi through edge and corridor effects. June 27- July 1, 2022 Madrid, Espagne.
Dissémination grand public
Mony, C., 2022. Les corridors écologiques au sein des paysages : des plantes aux microorganismes. SFE2. 28 octobre 2022. Montpellier, France.
Data put online according to the FAIR principle
https://github.com/HuJamie/Microbial.Corridor and https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA793385/
https://github.com/HuJamie/Weed-neighbourhood-effect-on-wheats and https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA811118/
Zenodo reference (DOI:10.5281/zenodo.7541448)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA901948/