L'objectif scientifique global du thème est de mieux intégrer les différents niveaux d’organisation biologique et d’échelle de temps dans l’étude des processus évolutifs. Il s’organise autour de trois grands axes:
- l’évolution des génomes et de leurs caractéristiques et le rôle des systèmes génétiques (polyploidie, recombinaison) et des traits d’histoire de vie dans cette évolution.
- la dynamique de l’adaptation à courte échelle de temps, combinant réponse plastique et adaptation, ou sur de plus longues périodes, comme lors de la domestication, à l’échelle génomique, des phénotypes individuels ou de l’holobionte.
- les processus de diversification et coexistence, incluant l’étude des mécanismes de spéciation, des interactions éco-évolutives, et de l’impact des traits sur les patrons de diversification.